（1）表面光滑、粒径大、性能良好的好氧颗粒污泥能够实现较好的污水处理效果，可以同时高效脱氮和除磷，并保持良好的有机物去除效果，还可以去除有毒有害物质；好氧颗粒污泥在不同种类废水处理过程中的效能、去除微污染物的机理方面需要进一步研究。
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（2）好氧颗粒污泥的形成是在多种机制共同影响下的结果，目前还缺乏能够准确完整描述其形成的假说，对其形成机理还需要进一步研究，特别是其形成过程中胞外聚合物的功能及调控措施。

（3）好氧颗粒污泥的培养过程中，污泥颗粒化以及颗粒污泥的各种特性受多因素的影响，任一因素的改变都可能导致颗粒污泥的解体、粒径大小的改变；今后应着重对于好氧颗粒污泥内各微生物之间的协作和生态位及其影响因素进行研究。

（4）对于好氧颗粒污泥的培养研究大多仍处于实验规模，未来应逐渐向实际污水发展；好氧颗粒污泥在实际应用中的稳定性仍然是一个挑战，今后需要对好氧颗粒污泥系统的稳定维持、节能和回收资源方面的影响因素及控制策略进行研究；另外，如何加速好氧颗粒污泥形成仍将是一个研究热点。